RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 PEX11BO96011 259 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 CEACAM5P06731 702 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 LHCGRP22888 699 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 ALDH4A1P30038 563 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 MAXP61244 160 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 DPYSL2Q16555 572 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 SGF29Q96ES7 293 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 SUFUQ9UMX1 484 aa22.83■■□□□ 1.25
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PKP3-210ENST00000533249 FGF1P05230 155 aa22.82■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 NFKBIAP25963 317 aa22.82■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 MANEAQ5SRI9 462 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 Q6ZVL8 140 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 BBS5Q8N3I7 341 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 EXD3Q8N9H8 876 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 TRIM11Q96F44 468 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 MGME1Q9BQP7 344 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 C9orf172C9J069 976 aa22.81■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 NFATC3Q12968 1075 aa22.8■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 ADCY8P40145 1251 aa22.78■■□□□ 1.24
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PKP3-210ENST00000533249 CDH6P55285 790 aa22.78■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 TMEM164Q5U3C3 297 aa22.78■■□□□ 1.24
PKP3-210ENST00000533249 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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