RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CD84Q9UIB8 345 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO18BQ8IUG5 2567 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 H3BRJ5 948 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CDK3Q00526 305 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TYRO3Q06418 890 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 NKAIN2Q5VXU1 208 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 POLNQ7Z5Q5 900 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 LZTR1Q8N653 840 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FNIP1Q8TF40 1166 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 DTD2Q96FN9 168 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF599Q96NL3 588 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 GSDMCQ9BYG8 508 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM4Q9C037 500 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO6Q9UM54 1294 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 SDK2Q58EX2 2172 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MAFKO60675 156 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CPNE6O95741 557 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MPSTP25325 297 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ARL4AP40617 200 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CTBSQ01459 385 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PMEPA1Q969W9 287 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 BTBD6Q96KE9 485 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 SOCS5O75159 536 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM87AP0C7U9 286 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 GZMAP12544 262 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 BIRC2Q13490 618 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 DPYSL2Q16555 572 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM74Q86UV6 250 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM159Q96B96 161 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MGME1Q9BQP7 344 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 SCINQ9Y6U3 715 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PDHA1P08559 390 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 RARAP10276 462 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CD1CP29017 333 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ADCY8P40145 1251 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 NAGSQ8N159 534 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 GBP4Q96PP9 640 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM117AQ9C073 453 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5MQ9NPB1 228 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PPM1DO15297 605 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PGLSO95336 258 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 PCK1P35558 622 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 MMP13P45452 471 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR1P46091 355 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ITKQ08881 620 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 DTX1Q86Y01 620 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 BBS5Q8N3I7 341 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 CLMPQ9H6B4 373 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1W2PQ67 120 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKCIP41743 596 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 ACTR1BP42025 376 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 ACTR1AP61163 376 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNC4Q03721 635 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 TBR1Q16650 682 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 BOLA3Q53S33 107 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 MARC1Q5VT66 337 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-205ENST00000527952 SPOCK2Q92563 424 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms