RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 FMO5P49326 533 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 SEPHS1P49903 392 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 TESK1Q15569 626 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 PNCKQ6P2M8 343 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 DOK6Q6PKX4 331 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 OR6C1Q96RD1 312 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 KLC2Q9H0B6 622 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 RUBCNLQ9H714 662 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.49■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF185O15231 689 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GNA15P30679 374 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GFERP55789 205 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 UGT8Q16880 541 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 LIPIQ6XZB0 460 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 IQCKQ8N0W5 287 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 LMO3Q8TAP4 145 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 PADI1Q9ULC6 663 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.48■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 TSPAN11A1L157 253 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 MED7O43513 233 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 TIAF1O95411 115 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ELFN1P0C7U0 828 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 SUOXP51687 545 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 SLC6A3Q01959 620 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CUL4AQ13619 759 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ACOX1Q15067 660 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CFAP58Q5T655 872 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FAM131BQ86XD5 332 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 LHX9Q9NQ69 397 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 LHX3Q9UBR4 397 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.47■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1B0GVL5 298 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 ETFBP38117 255 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 FASLGP48023 281 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 RAB6CQ53S08 254 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 THAP4Q8WY91 577 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.46■□□□□ 0.07
ALYREF-204ENST00000512673 HEATR9A2RTY3 570 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 KDELR3O43731 214 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 RAMP2O60895 175 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 SPAG6O75602 509 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 CEACAM4O75871 244 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 CLCN1P35523 988 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 PER3P56645 1201 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 HHEXQ03014 270 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 DENND2CQ68D51 928 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 NLRP14Q86W24 1093 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 SFRP1Q8N474 314 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 SYNCQ9H7C4 482 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.45■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 FAM72CH0Y354 149 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 RECKO95980 971 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 PFKFB1P16118 471 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 KRTAP10-9P60411 292 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 CDK3Q00526 305 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 GCNT1Q02742 428 aa15.44■□□□□ 0.06
ALYREF-204ENST00000512673 CYTH1Q15438 398 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms