RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SIK2Q9H0K1 926 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CA14Q9ULX7 337 aa7.56□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 E9PAM4 449 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 FAM72CH0Y354 149 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TSPAN3O60637 253 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SRGAP2O75044 1071 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 KRT1P04264 644 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DRD1P21728 446 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ENPP1P22413 925 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CTNNA2P26232 953 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HOXA6P31267 233 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MARCKSL1P49006 195 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ROM1Q03395 351 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 GAD2Q05329 585 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SEMA3BQ13214 749 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 KRT81Q14533 505 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DPYSL2Q16555 572 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MPPE1Q53F39 396 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF569Q5MCW4 686 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MANEALQ5VSG8 457 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 LRRC31Q6UY01 552 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 C14orf80Q86SX3 495 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 FAM72BQ86X60 149 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM25Q86YD3 366 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 KCTD6Q8NC69 237 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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GARNL3-222ENST00000498801 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DIRC2Q96SL1 478 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PRRX2Q99811 253 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 AMFRQ9UKV5 643 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.55□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 LRRD1A4D1F6 860 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DRGXA6NNA5 263 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 NCAM2O15394 837 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CREB3O43889 395 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TBL1XO60907 577 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TULP3O75386 442 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CD48P09326 243 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 TDGF1P13385 188 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 GOT1P17174 413 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 CCND1P24385 295 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 EPHB2P29323 1055 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 AVPR2P30518 371 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HOXC13P31276 330 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HTR7P34969 479 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 HCAR3P49019 387 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 PEX5P50542 639 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 DNA2P51530 1060 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 IRAK1P51617 712 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 SGSHP51688 502 aa7.54□□□□□ -1.2
GARNL3-222ENST00000498801 ARSEP51690 589 aa7.54□□□□□ -1.2
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