RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TP53INP1Q96A56 240 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 COG8Q96MW5 612 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC77Q9BR77 488 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SPON2Q9BUD6 331 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MARCH5Q9NX47 278 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 NENFQ9UMX5 172 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PQH9 124 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 M0QX08 132 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GUCA1CO95843 209 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CXCL10P02778 98 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GRK2P25098 689 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GPD2P43304 727 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ERVFC1P60507 584 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ARHGAP8P85298 464 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ITKQ08881 620 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MAMLD1Q13495 774 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 STAT4Q14765 748 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GPR141Q7Z602 305 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MAP6Q96JE9 813 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SMOQ99835 787 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TLR9Q9NR96 1032 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 COG5Q9UP83 839 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.25□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 WDR27A2RRH5 827 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SYCE1LA8MT33 242 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GIPC1O14908 333 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 LTFP02788 710 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 HEXBP07686 556 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF3P17036 446 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ARL4AP40617 200 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SLC18A1P54219 525 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 B2MP61769 119 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 IRX4P78413 519 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 FAM189BP81408 668 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CYP4F8P98187 520 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 DNASE1L3Q13609 305 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 INAVAQ3KP66 663 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 VPS45Q9NRW7 570 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MALT1Q9UDY8 824 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 A0A1W2PRU2 124 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MTMR11A4FU01 709 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01553A4QN01 128 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 OR6C75A6NL08 312 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SYN3O14994 580 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 JRKO75564 520 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 ENDOD1O94919 500 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 H6PDO95479 791 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 BPNT1O95861 308 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SOD2P04179 222 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 MMP8P22894 467 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 GNG2P59768 71 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 SLC6A3Q01959 620 aa7.24□□□□□ -1.25
ROBO1-211ENST00000498428 PPP2R5DQ14738 602 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms