RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 Q6ZVL8 140 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CDC6Q99741 560 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CAPN8A6NHC0 703 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 SIGLEC6O43699 453 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PMPCBO75439 489 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CLDN7O95471 211 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PIRTP0C851 137 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GIMD1P0DJR0 217 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ETS1P14921 441 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CA4P22748 312 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NFKBIAP25963 317 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PTSQ03393 145 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MTM1Q13496 603 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PTK2BQ14289 1009 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NFATC4Q14934 902 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 FAXCQ5TGI0 409 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PNCKQ6P2M8 343 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 MACC1Q6ZN28 852 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GLRX5Q86SX6 157 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 PRELID2Q8N945 189 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LMX1AQ8TE12 382 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TADA1Q96BN2 335 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 DTD2Q96FN9 168 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 VAT1Q99536 393 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 LGR4Q9BXB1 951 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-214ENST00000498219 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TMEM202A6NGA9 273 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TNFSF14O43557 240 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PSMB4P28070 264 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 KCNJ1P48048 391 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CCNG2Q16589 344 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ALG11Q2TAA5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 HID1Q8IV36 788 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SCAMP4Q969E2 229 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 IFT43Q96FT9 208 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SPATA13Q96N96 652 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 FCRL5Q96RD9 977 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TRIB3Q96RU7 358 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ABCG8Q9H221 673 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CTAGE9A4FU28 777 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 C5orf60A6NFR6 353 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 H3BM21 787 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PSMD11O00231 422 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 TOR1BO14657 336 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 GCATO75600 419 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 METTL18O95568 372 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SLC4A1P02730 911 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 STC1P52823 247 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 WNT3AP56704 352 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CLDN6P56747 220 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PPARDQ03181 441 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CDK18Q07002 472 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 CDKN3Q16667 212 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 KDELC1Q6UW63 502 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-214ENST00000498219 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms