RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	ANXA9	O76027	345 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	METTL18	O95568	372 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GPR1	P46091	355 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MPP3	Q13368	585 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MTM1	Q13496	603 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PTK2B	Q14289	1009 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SPARCL1	Q14515	664 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	AGER	Q15109	404 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SLC14A2	Q15849	920 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC157	Q569K6	752 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ALS2CL	Q60I27	953 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PIP4P1	Q86T03	277 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PARG	Q86W56	976 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	HID1	Q8IV36	788 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	RBFA	Q8N0V3	343 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	EID2	Q8N6I1	236 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	AP2M1	Q96CW1	435 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	LGR4	Q9BXB1	951 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	KLF15	Q9UIH9	416 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF711	Q9Y462	761 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CACNA1A	O00555	2505 aa		9.81	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM202	A6NGA9	273 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024		H3BM21	787 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	AURKA	O14965	403 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	YKT6	O15498	198 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHGA12	O60330	932 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GCAT	O75600	419 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PIAS2	O75928	621 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	EPO	P01588	193 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CSF2	P04141	144 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ETS1	P14921	441 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TSHR	P16473	764 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	JUND	P17535	347 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	DGKA	P23743	735 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	HTR1B	P28222	390 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GRK6	P43250	576 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	KCNJ1	P48048	391 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SPINT3	P49223	89 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GNG11	P61952	73 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PPARD	Q03181	441 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	C1orf61	Q13536	156 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	NFATC4	Q14934	902 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SLC1A5	Q15758	541 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	CDKN3	Q16667	212 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	INAVA	Q3KP66	663 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	DOK6	Q6PKX4	331 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MACC1	Q6ZN28	852 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM74	Q86UV6	250 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	LMX1A	Q8TE12	382 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SAP25	Q8TEE9	199 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PBK	Q96KB5	322 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	WDR92	Q96MX6	357 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	LYSMD1	Q96S90	227 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	AGAP2	Q99490	1192 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	WDR26	Q9H7D7	661 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	GPR27	Q9NS67	375 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	KL	Q9UEF7	1012 aa		9.8	□□□□□ -0.84
CALD1-223	ENST00000496024	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84

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