RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 GRIK2Q13002 908 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 TRNP1Q6NT89 227 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 FIG4Q92562 907 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 TMEM19Q96HH6 336 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 LMLNQ96KR4 655 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 EBF2Q9HAK2 575 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa5.97□□□□□ -1.45
USP34-216ENST00000487547 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MID1O15344 667 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CCNDBP1O95273 360 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CYC1P08574 325 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 BDKRB2P30411 391 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 BSGP35613 385 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FASLGP48023 281 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 OLR1P78380 273 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SYT16Q17RD7 645 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TSSK4Q6SA08 328 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 POC1AQ8NBT0 407 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 RND1Q92730 232 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MMP25Q9NPA2 562 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TINAGQ9UJW2 476 aa5.96□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 BUB3O43684 328 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SPARCP09486 303 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KRT10P13645 584 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DDIT3P35638 169 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CCR9P51686 369 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 RGMBQ6NW40 437 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PAF1Q8N7H5 531 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SGCDQ92629 289 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CDCA5Q96FF9 252 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FEM1CQ96JP0 617 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 C7orf26Q96N11 449 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 C1RLQ9NZP8 487 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 AMDHD2Q9Y303 409 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CAPN7Q9Y6W3 813 aa5.95□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 A0A0G2JPF8 293 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 J3KRW8 73 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TULP2O00295 520 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ATP1A3P13637 1013 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 HOXC9P31274 260 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FOXM1Q08050 763 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FRG2Q64ET8 278 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PIP5K1AQ99755 562 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 USP44Q9H0E7 712 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 VPS33BQ9H267 617 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZNF69Q9UC07 566 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.94□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SPINT2O43291 252 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PAGE4O60829 102 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FTCDO95954 541 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 USP8P40818 1118 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 NLRP5P59047 1200 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZBED6P86452 979 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PDE1BQ01064 536 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ALG11Q2TAA5 492 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ACCSLQ4AC99 568 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms