RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, human

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNN3-206	ENST00000487539	FOLR3	P41439	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	NPTX2	P47972	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	IFNAR2	P48551	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	NAPA	P54920	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	BFSP1	Q12934	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	EMC2	Q15006	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	USP37	Q86T82	979 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ANK1	P16157	1881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539		A0A0B4J269	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SYN3	O14994	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	MPPED1	O15442	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TRIAP1	O43715	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	USP12	O75317	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	MX1	P20591	662 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ITGAL	P20701	1170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	GATA3	P23771	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CD6	P30203	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	JAK3	P52333	1124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	GPR17	Q13304	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TUBB3	Q13509	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TGIF1	Q15583	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539		A0A088AWK7	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539		F5H697	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	IKBKB	O14920	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ASAP2	O43150	1006 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ANP32C	O43423	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	OAZ2	O95190	189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	AHSG	P02765	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	WNT1	P04628	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	APOD	P05090	189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	HOXB2	P14652	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CDC25C	P30307	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	SFN	P31947	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CIITA	P33076	1130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ARL2	P36404	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	KCNJ5	P48544	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	CCT8	P50990	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	NXPH1	P58417	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	OSTN	P61366	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	MC2R	Q01718	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	FGL2	Q14314	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	PTPRR	Q15256	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNN3-206	ENST00000487539	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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