RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS12P58397 1594 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNJ2O15056 1496 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 J3KR12 359 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC2A4P14672 509 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 MX1P20591 662 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PAX7P23759 505 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SSTR2P30874 369 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PIGAP37287 484 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF75DP51815 510 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 DLG1Q12959 904 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 GRIK3Q13003 919 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGADQ13349 1161 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NEDD9Q14511 834 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF329Q86UD4 541 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX11Q8IYF3 940 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 GJC3Q8NFK1 279 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 BICD1Q96G01 975 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 IL17FQ96PD4 163 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3GL3Q99963 347 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 VEZTQ9HBM0 779 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 MDFICQ9P1T7 246 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SAMD9Q5K651 1589 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCC2Q92887 1545 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PLB1Q6P1J6 1458 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ADCY10Q96PN6 1610 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ELP1O95163 1332 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 TSPOAP1O95153 1857 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP74Q9C0B2 1584 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 TMCO5BA8MYB1 307 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NEMFO60524 1076 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 KINO60870 393 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ERLIN2O94905 339 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SRD5A1P18405 259 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP2R1AP30153 589 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 RWDD2BP57060 319 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NUCB1Q02818 461 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ESCO2Q56NI9 601 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 USP43Q70EL4 1123 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF114Q8NC26 417 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA20Q8TB22 786 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NEK9Q8TD19 979 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NR4A3Q92570 626 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SCMH1Q96GD3 660 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 TWNKQ96RR1 684 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 EYA3Q99504 573 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NUF2Q9BZD4 464 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP160Q12769 1436 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 USP27XA6NNY8 438 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms