RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 H3BRJ5 948 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 I6L893 689 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TM9SF1O15321 606 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KCNN4O15554 427 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SNX3O60493 162 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM155BO75949 473 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 F9P00740 461 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IL1BP01584 269 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IGLV3-19P01714 112 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ASLP04424 464 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 C1QTNF9P0C862 333 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IL4RP24394 825 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCR1P32246 355 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLC8A1P32418 973 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HOXD12P35452 270 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DPP6P42658 865 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RELBQ01201 579 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 E2F5Q15329 346 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CST6Q15828 149 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HLA-BQ31612 363 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BBS9Q3SYG4 887 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCDC157Q569K6 752 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MPP7Q5T2T1 576 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TRNP1Q6NT89 227 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CYS1Q717R9 158 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BEND5Q7L4P6 421 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 AADATQ8N5Z0 425 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PQLC3Q8N755 202 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PTPRN2Q92932 1015 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NTAN1Q96AB6 310 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BIRC7Q96CA5 298 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PWWP2AQ96N64 755 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM129BQ96TA1 746 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OMDQ99983 421 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EBF2Q9HAK2 575 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 USP29Q9HBJ7 922 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MPP6Q9NZW5 540 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TBK1Q9UHD2 729 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KLK13Q9UKR3 277 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.31□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 H3BM21 787 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 WNT9AO14904 365 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MTSS1O43312 755 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 WIPF1O43516 503 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SNAP91O60641 907 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GJB3O75712 270 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TMEM63AO94886 807 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ASMTLO95671 621 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IGHV4-34P06331 123 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 INHBAP08476 426 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MLNP12872 115 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GLDCP23378 1020 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GCAP28676 217 aa6.3□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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