RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SMPD2	O60906	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TACR2	P21452	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ADRA1D	P25100	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	POU1F1	P28069	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ACADL	P28330	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PDE1A	P54750	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	DMWD	Q09019	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RALGDS	Q12967	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PTK6	Q13882	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TRIAP1	O43715	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KRT10	P13645	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	IDUA	P35475	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RHAG	Q02094	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TNIP1	Q15025	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KAT2A	Q92830	837 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KDR	P35968	1356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC25A17	O43808	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KCNK5	O95279	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	P4HA1	P13674	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KRT2	P35908	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	EPHB4	P54760	987 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	AVIL	O75366	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	RAD17	O75943	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	WNT11	O96014	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CDKN1A	P38936	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	STARD6	P59095	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	OLFM1	Q99784	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCFC2-205	ENST00000470197	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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