RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 DENND2CQ68D51 928 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 DTD2Q96FN9 168 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 NOD2Q9HC29 1040 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ANO10Q9NW15 660 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 SUFUQ9UMX1 484 aa22.6■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 A0A1W2PQ67 120 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 LRCH4O75427 683 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 LHCGRP22888 699 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 GNPDA1P46926 289 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 POLD2P49005 469 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 CDK3Q00526 305 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 NFKB2Q00653 900 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ZNF235Q14590 738 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 TMEM164Q5U3C3 297 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 RCBTB1Q8NDN9 531 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 PATE1Q8WXA2 126 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 SEMA3CQ99985 751 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 TRIM4Q9C037 500 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 IL17BQ9UHF5 180 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 MYO6Q9UM54 1294 aa22.59■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 CPP00450 1065 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ATP1A3P13637 1013 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 GPR3P46089 330 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ARSDP51689 593 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 CTBSQ01459 385 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 TRAF2Q12933 501 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 PTPRRQ15256 657 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 Q6ZVL8 140 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 NAGSQ8N159 534 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ZWILCHQ9H900 591 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.58■■□□□ 1.21
USP4-208ENST00000464168 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PPM1DO15297 605 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MAFKO60675 156 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SFTPCP11686 197 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 AMPD1P23109 780 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 IL1R2P27930 398 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TEAD1P28347 426 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ADCY8P40145 1251 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP4-208ENST00000464168 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PMEPA1Q969W9 287 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SCRN2Q96FV2 425 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CCDC74BQ96LY2 380 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TAAR9Q96RI9 348 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MGME1Q9BQP7 344 aa22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 STMND1H3BQB6 276 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PSMD11O00231 422 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP6O43182 974 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ZW10O43264 779 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SUV39H1O43463 412 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 IVLP07476 585 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GZMAP12544 262 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SQSTM1Q13501 440 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 DPYSL2Q16555 572 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 STX1AQ16623 288 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 NKD1Q969G9 470 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.56■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SDK2Q58EX2 2172 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 A0A0U1RQS6 177 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 LRRC53A6NM62 1247 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 H3BRJ5 948 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PGLSO95336 258 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TCF4P15884 667 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 NFKBIAP25963 317 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PCK1P35558 622 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MAXP61244 160 aa22.55■■□□□ 1.2
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