RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ELFN1	P0C7U0	828 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	TRIM23	P36406	574 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ETFB	P38117	255 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MMP12	P39900	470 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ADCY8	P40145	1251 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PTGIR	P43119	386 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GLRB	P48167	497 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	KYNU	Q16719	465 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	UGT8	Q16880	541 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RESP18	Q5W5W9	173 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	DOK6	Q6PKX4	331 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	TBCB	Q99426	244 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	NPY6R	Q99463	290 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SYNC	Q9H7C4	482 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	LHX9	Q9NQ69	397 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	COPG2	Q9UBF2	871 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MTMR6	Q9Y217	621 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	LRP4	O75096	1905 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFHX3	Q15911	3703 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM170A	A1A519	330 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RASA4B	C9J798	803 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RASA4	O43374	803 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	KDELR3	O43731	214 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RAMP2	O60895	175 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	YEATS4	O95619	227 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	F9	P00740	461 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ERBB2	P04626	1255 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ITGA3	P26006	1051 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GNA15	P30679	374 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	USP8	P40818	1118 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FASLG	P48023	281 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FMO5	P49326	533 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC6A3	Q01959	620 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	HHEX	Q03014	270 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	RALGDS	Q12967	914 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	IL10RA	Q13651	578 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	TESK1	Q15569	626 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	DENND2C	Q68D51	928 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	LIPI	Q6XZB0	460 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FJX1	Q86VR8	437 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM131B	Q86XD5	332 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SEC14L1	Q92503	715 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC35C1	Q96A29	364 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MAGEH1	Q9H213	219 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR83	Q9NYM4	423 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	NF1	P21359	2839 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-222	ENST00000449504	PDZD2	O15018	2839 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	C2orf72	A6NCS6	295 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	C21orf140	B9A014	251 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	RASSF9	O75901	435 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM63A	O94886	807 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	EML2	O95834	649 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	MT-ND3	P03897	115 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	COX6B1	P14854	86 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	PTPN4	P29074	926 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HDLBP-222	ENST00000449504	PTGER4	P35408	488 aa		7.14	□□□□□ -1.27

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