RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TCHPQ9BT92 498 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 IFT22Q9H7X7 185 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CD93Q9NPY3 652 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ANO10Q9NW15 660 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DKK3Q9UBP4 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 RAD54BQ9Y620 910 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 ULK1O75385 1050 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 CSO75390 466 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 KCNE1P15382 129 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A9P48067 706 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 TPMTP51580 245 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 PER3P56645 1201 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 STX1AQ16623 288 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 COL12A1Q99715 3063 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 ASB6Q9NWX5 421 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 NOMO1Q15155 1222 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRK-211ENST00000429595 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 SATB2Q9UPW6 733 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-211ENST00000429595 MGAQ8IWI9 3026 aa6.45□□□□□ -1.38
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