RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0U1RQS6 177 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEATR9A2RTY3 570 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC31A1O15431 190 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDB2O43679 373 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRTAMO95727 393 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPH1P17752 444 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITPKAP23677 461 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADRA1DP25100 572 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AKT2P31751 481 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPY2RP49146 381 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPINT3P49223 89 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITGA8P53708 1063 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PFN3P60673 137 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE1BQ01064 536 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC14Q15048 493 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACOX1Q15067 660 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q6ZVL8 140 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IQCHQ86VS3 1027 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYT12Q8IV01 421 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX19Q92543 992 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PEX13Q92968 403 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUS1Q96E22 293 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERAC1Q96JX3 654 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERPINB12Q96P63 405 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR27Q9NS67 375 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BFARQ9NZS9 450 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB23Q9ULC3 237 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX24Q9Y343 169 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARL5AQ9Y689 179 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.15□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1B0GTW7 788 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PR77 199 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2orf81A6NN90 581 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FPGTO14772 594 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VILLO15195 856 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAD51BO15315 384 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AVILO75366 819 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOD1P00441 154 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PYGLP06737 847 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RETP07949 1114 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNSP15586 552 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAOBP27338 520 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM23P36406 574 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NHLH1Q02575 133 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAV1Q03135 178 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACVR1Q04771 509 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OVGP1Q12889 678 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CALCOCO2Q13137 446 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTM1Q13496 603 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POU6F1Q14863 301 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IRF4Q15306 451 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCID2Q5JVF3 399 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DENND2CQ68D51 928 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNCKQ6P2M8 343 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR26Q8NDV2 337 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP76Q8TAP6 659 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLK6Q92876 244 aa8.14□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ART4Q93070 314 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 355.6 ms