RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 RXRGP48443 463 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PFN3P60673 137 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 IL9RQ01113 521 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGEF7Q14155 803 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PCSK7Q16549 785 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 FAXCQ5TGI0 409 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 IFT43Q96FT9 208 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CHKBQ9Y259 395 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.8■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CAPN8A6NHC0 703 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 E7EVH7 732 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PSMD3O43242 534 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PDHA1P08559 390 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PTGIRP43119 386 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 GRK6P43250 576 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 VPS41P49754 854 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 THOP1P52888 689 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 WNT3AP56704 352 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 YPEL5P62699 121 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CDK18Q07002 472 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PTK2BQ14289 1009 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 IHHQ14623 411 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ACOX1Q15067 660 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CNGA3Q16281 694 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 KDELC1Q6UW63 502 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PARGQ86W56 976 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 JAMLQ86YT9 394 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 IPMKQ8NFU5 416 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.79■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CACNA1AO00555 2505 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 A0A0J9YYE9 177 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 A8MX80 341 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 SH3BP5O60239 455 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 TRBC1P01850 177 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF30P17039 623 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CTPS1P17812 591 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 LMAN1P49257 510 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 GPS1Q13098 491 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 MTM1Q13496 603 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PTK6Q13882 451 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.78■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 FAM187AA6NFU0 413 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 TTI1O43156 1089 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PCCBP05166 539 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 ALPIP09923 528 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 LHCGRP22888 699 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA5AQ13591 1074 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 NUS1Q96E22 293 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 COQ10AQ96MF6 247 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 FICDQ9BVA6 458 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.77■□□□□ 0.92
C4orf48-201ENST00000409248 H3BM21 787 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 AP2A1O95782 977 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 NDST3O95803 873 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 PRLP01236 227 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 EPOP01588 193 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 HNF1BP35680 557 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 FOXK2Q01167 660 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 FZD2Q14332 565 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 SHBQ15464 509 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC66Q68CR7 880 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 DENND2CQ68D51 928 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 MACC1Q6ZN28 852 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 SAP25Q8TEE9 199 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 DTD2Q96FN9 168 aa20.76■□□□□ 0.91
C4orf48-201ENST00000409248 TRIB3Q96RU7 358 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms