RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 COQ10AQ96MF6 247 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TEX101Q9BY14 249 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.25■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 C2CD4BA6NLJ0 364 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL8A6PVC2 850 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PDGFAP04085 211 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 MMEP08473 750 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA4P29622 427 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB3Q8N7B9 438 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 FAM172AQ8WUF8 416 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 NTAN1Q96AB6 310 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 NUS1Q96E22 293 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 NSMCE3Q96MG7 304 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ZPBPQ9BS86 351 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa19.24■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 WASH4PA8MWX3 477 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 LSM8O95777 96 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 MAN1A1P33908 653 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ACTR1BP42025 376 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN9P43378 593 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1DP48730 415 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ACTR1AP61163 376 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 BCL2L1Q07817 233 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ERV3-1Q14264 604 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 SLFN11Q7Z7L1 901 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PAF1Q8N7H5 531 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A3Q99624 504 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALT6Q9UBX8 382 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TLK1Q9UKI8 766 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.23■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CREB3O43889 395 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CDK3Q00526 305 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM135Q86UB9 458 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 OR10G6Q8NH81 332 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC19Q9H756 370 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF11O60813 436 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 IVLP07476 585 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF28P17035 718 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 DLSTP36957 453 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 FASLGP48023 281 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 PEX6Q13608 980 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CNGA3Q16281 694 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 DENND2CQ68D51 928 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 DOK6Q6PKX4 331 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 ESX1Q8N693 406 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 NCSTNQ92542 709 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.21■□□□□ 0.67
HOXD12-201ENST00000404162 RFPL1O75677 317 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 EML2O95834 649 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 MAP7Q14244 749 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 FAM114A1Q8IWE2 563 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL3Q9UH77 587 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CROTQ9UKG9 612 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 POLHQ9Y253 713 aa19.2■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CELSR2Q9HCU4 2923 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6CA6NDK9 693 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6BA6NDN3 693 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 PALMO75781 387 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K6O95382 1288 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6DP0CG33 693 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 MMP8P22894 467 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 DCTP40126 519 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 ETV3P41162 512 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SCYL2Q6P3W7 929 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SLC30A5Q8TAD4 765 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 EPS8L1Q8TE68 723 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 DTD2Q96FN9 168 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 OR2M4Q96R27 311 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXD12-201ENST00000404162 SRPK3Q9UPE1 567 aa19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms