RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT37O76014 449 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT38O76015 456 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 UGT2B4P06133 528 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 MSL3P1P0C860 447 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 KRT15P19012 456 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GCAP28676 217 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 HADHAP40939 763 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 MASP1P48740 699 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 COPAP53621 1224 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PRAMEP78395 509 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ACVR1Q04771 509 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 VAC14Q08AM6 782 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF234Q14588 700 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CNGA3Q16281 694 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 UGP2Q16851 508 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 MTBPQ96DY7 904 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CHFRQ96EP1 664 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 LYSMD1Q96S90 227 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CPNE1Q99829 537 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM245Q9H330 911 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF711Q9Y462 761 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 EYSQ5T1H1 3165 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 TSPAN11A1L157 253 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 LEFTY1O75610 366 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 VAPBO95292 243 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PIRTP0C851 137 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ERVK-10P10266 1014 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 DRD1P21728 446 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GKP32189 559 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 HMGCLP35914 325 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GP5P40197 560 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 MESP2Q0VG99 397 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 KCTD16Q68DU8 428 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CHST14Q8NCH0 376 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PTPRN2Q92932 1015 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ZBTB9Q96C00 473 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 TLCD1Q96CP7 247 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF778Q96MU6 729 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 DKK3Q9UBP4 350 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 PKP3Q9Y446 797 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 ARL5AQ9Y689 179 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.47□□□□□ -1.21
HIVEP1-202ENST00000399469 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 CCDC78A2IDD5 438 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 SIN3BO75182 1162 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 PRKCGP05129 697 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 EPHX1P07099 455 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF30P17039 623 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 NR1D1P20393 614 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC8A1P32418 973 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 SOX9P48436 509 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 GALK1P51570 392 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 COX10Q12887 443 aa7.46□□□□□ -1.22
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJC3Q13217 504 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms