RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 KLHL33A6NCF5 533 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AZIN1O14977 448 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PIP5K1BO14986 540 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 LDB2O43679 373 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RAMP2O60895 175 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TMCC1O94876 653 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 H6PDO95479 791 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 GFAPP14136 432 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SH3BP2P78314 561 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RPS6KA2Q15349 733 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PFKFB4Q16877 469 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 BORAQ6PGQ7 559 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 NUP93Q8N1F7 819 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TEX26Q8N6G2 289 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZIC5Q96T25 663 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TCF12Q99081 682 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SLC29A1Q99808 456 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ATXN10Q9UBB4 475 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 AURKCQ9UQB9 309 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SCML2Q9UQR0 700 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 UBXN8O00124 270 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 CDK14O94921 469 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ATP6V1B2P21281 511 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IHHQ14623 411 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 INPP5AQ14642 412 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DDR2Q16832 855 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TBCELQ5QJ74 424 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 IL31Q6EBC2 164 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RETREG3Q86VR2 466 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ANKFN1Q8N957 763 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SH3RF2Q8TEC5 729 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 SEMA3CQ99985 751 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARMC1Q9NVT9 282 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 ARL5AQ9Y689 179 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-201ENST00000398741 A0A1B0GTW7 788 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 CRCPO75575 148 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 FGF1P05230 155 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 FGF4P08620 206 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ZNF23P17027 643 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 CKMT2P17540 419 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 NELFEP18615 380 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 HLA-DPA1P20036 260 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 GPR15P49685 360 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 IL10RBQ08334 325 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ZNF235Q14590 738 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 IFNL1Q8IU54 200 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 PGBD5Q8N414 524 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 GID8Q9NWU2 228 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 GMIPQ9P107 970 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 DHRS12A0PJE2 317 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 H3BSA7 217 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-201ENST00000398741 NME4O00746 187 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms