RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NTAN1Q96AB6 310 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52E6Q96RD3 313 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC189A1A4V9 331 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BN98 237 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LGR5O75473 907 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MMP3P08254 477 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A1P30825 629 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK8P45983 427 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 BRCC3P46736 316 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 USP46P62068 366 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIK3Q13003 919 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KBTBD8Q8NFY9 601 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOQP17081 205 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PHKG1Q16816 387 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ARMC3Q5W041 872 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM198Q66K66 360 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR142Q7Z601 462 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB9Q96DX5 294 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 EXOC2Q96KP1 924 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TBATAQ96M53 351 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 OR52B2Q96RD2 323 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJA2O60884 412 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CATP04040 527 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LMO2P25791 158 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFV1P49821 464 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ITIH5Q86UX2 942 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MYDGFQ969H8 173 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PLK2Q9NYY3 685 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A4O43246 635 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MC4RP32245 332 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IRF9Q00978 393 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF460Q14592 562 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 FGD3Q5JSP0 725 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HECTD3Q5T447 861 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ASRGL1Q7L266 308 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TAC4Q86UU9 113 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NTRK1P04629 796 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC16A1P53985 500 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CLCQ05315 142 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TUSC3Q13454 348 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MBLAC2Q68D91 279 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PAOXQ6QHF9 649 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM22Q9Y584 194 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.36■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PAM4 449 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 THRBP10828 461 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IMPDH2P12268 514 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TALDO1P37837 337 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PARP15Q460N3 678 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 STYXQ8WUJ0 223 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ITCHQ96J02 903 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFP42Q96MM3 310 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRJQ12913 1337 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NDST3O95803 873 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC42P60953 191 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DLG1Q12959 904 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 USP45Q70EL2 814 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NELL1Q92832 810 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms