RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SCAMP4Q969E2 229 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MS4A14Q96JA4 679 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 FCRL5Q96RD9 977 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 CLPBQ9H078 707 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GBA3Q9H227 469 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 FGF22Q9HCT0 170 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 GDF3Q9NR23 364 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ST14Q9Y5Y6 855 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 U3KQA8 63 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.46□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PSMD11O00231 422 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF185O15231 689 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GPR39O43194 453 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SIGLEC6O43699 453 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 USP12O75317 370 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NDST3O95803 873 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 AGTP01019 485 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM5P06731 702 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ITGAVP06756 1048 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ADRB1P08588 477 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM1P13688 526 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NME1P15531 152 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 BPIP17213 487 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 JUNDP17535 347 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SPINK2P20155 84 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SDHBP21912 280 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TEAD1P28347 426 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PMLP29590 882 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GRIA1P42261 906 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GRK6P43250 576 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RABIFP47224 123 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KCNJ1P48048 391 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CLDN6P56747 220 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KIAA1024LP59773 190 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 YPEL5P62699 121 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CDK3Q00526 305 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DPTQ07507 201 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC3Q13217 504 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MPP3Q13368 585 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MTM1Q13496 603 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SNX1Q13596 522 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NFATC4Q14934 902 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ACOX1Q15067 660 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TCEA2Q15560 299 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC1A5Q15758 541 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC14A2Q15849 920 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PROX2Q3B8N5 592 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TTC27Q6P3X3 843 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MACC1Q6ZN28 852 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 USP45Q70EL2 814 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM74Q86UV6 250 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NLRP8Q86W28 1048 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PARGQ86W56 976 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NRROSQ86YC3 692 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 EID2Q8N6I1 236 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PRELID2Q8N945 189 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GPR26Q8NDV2 337 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IPMKQ8NFU5 416 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms