RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 WASH4PA8MWX3 477 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TPP1O14773 563 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 AQP9O43315 295 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 SNX2O60749 519 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CALB1P05937 261 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TYRP1P17643 537 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 EPHB2P29323 1055 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 CCT5P48643 541 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 GUSBP11Q6P575 273 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 RBFAQ8N0V3 343 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 NETO2Q8NC67 525 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 IFI44Q8TCB0 444 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TM9SF2Q99805 663 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 LRRC61Q9BV99 259 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 PDFQ9HBH1 243 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 LHX3Q9UBR4 397 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 FZD10Q9ULW2 581 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 KALRNO60229 2985 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TSPAN11A1L157 253 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 INSIG1O15503 277 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 RASA4O43374 803 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 BUB1O43683 1085 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CSO75390 466 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 IGSF6O95976 241 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MPOP05164 745 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TPM2P07951 284 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 ITIH2P19823 946 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 TGM2P21980 687 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 MYL5Q02045 173 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 OGDHQ02218 1023 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CDKN3Q16667 212 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 PARP15Q460N3 678 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 EFHC2Q5JST6 749 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CFAP161Q6P656 301 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MACC1Q6ZN28 852 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 VPS36Q86VN1 386 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 NEK11Q8NG66 645 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MAPK15Q8TD08 544 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 LMX1AQ8TE12 382 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 CNPY3Q9BT09 278 aa7.03□□□□□ -1.28
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CTXN3-201ENST00000379445 LRRC19Q9H756 370 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTXN3-201ENST00000379445 MGAQ8IWI9 3026 aa7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 LMO7DNF2Z398 122 aa7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 TOR1BO14657 336 aa7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTXN3-201ENST00000379445 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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