RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 ANKFN1Q8N957 763 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 LRCH3Q96II8 777 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 KLHL33A6NCF5 533 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 UBXN8O00124 270 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PPP6CO00743 305 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ATP6V1B2P21281 511 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TNK2Q07912 1038 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 EFEMP1Q12805 493 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 IGSF8Q969P0 613 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 CCT7Q99832 543 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ARMC1Q9NVT9 282 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 MAP10Q9P2G4 905 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ARL5AQ9Y689 179 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 AZIN1O14977 448 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PIP5K1BO14986 540 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 AKAP10O43572 662 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 H6PDO95479 791 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ACVR1Q04771 509 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PTPRCAPQ14761 206 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 OR4D1Q15615 310 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PFKFB4Q16877 469 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 KRT80Q6KB66 452 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 MIER2Q8N344 545 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 SEMA3CQ99985 751 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 OCEL1Q9H607 264 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GMIPQ9P107 970 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 THEGQ9P2T0 379 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GJB3O75712 270 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 IL10RBQ08334 325 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GRB7Q14451 532 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 FBXL22Q6P050 247 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 DDIASQ8IXT1 998 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 TRPV1Q8NER1 839 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR150Q8NGU9 434 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTR1B-201ENST00000289228 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 H3BSA7 217 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 NME4O00746 187 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 IGHA2P01877 340 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 BMP2P12643 396 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 CKMT2P17540 419 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 FOXA1P55317 472 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 PRKCQQ04759 706 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 SEMA3AQ14563 771 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 KANK2Q63ZY3 851 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 IL31Q6EBC2 164 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ANGPT2O15123 496 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 RAMP2O60895 175 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ZNF23P17027 643 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 SUOXP51687 545 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 TCF12Q99081 682 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 TRIM15Q9C019 465 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTR1B-201ENST00000289228 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms