RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CACNG1Q06432 222 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GPR135Q8IZ08 494 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FLCNQ8NFG4 579 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 AP1S1P61966 158 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 EPS8Q12929 822 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DLK2Q6UY11 383 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NMUR1Q9HB89 426 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARHGAP1Q07960 439 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SEMA5AQ13591 1074 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ALG11Q2TAA5 492 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 KLHL1Q9NR64 748 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DMAC2Q9NW81 257 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 COG5Q9UP83 839 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MATN3O15232 486 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZMPSTE24O75844 475 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ITGA2P17301 1181 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SSR2P43308 183 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CAP1Q01518 475 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TLE2Q04725 743 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RNF43Q68DV7 783 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FANCEQ9HB96 536 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NID2Q14112 1375 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 A0A1W2PPM1 405 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRIM24O15164 1050 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NDST2P52849 883 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RNF44Q7L0R7 432 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PHC3Q8NDX5 983 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZNF384Q8TF68 577 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SERHLQ9NQF3 203 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SRRDQ9UH36 339 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GGA2Q9UJY4 613 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 RFXANKO14593 260 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TNFAIP8O95379 198 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLITRK2Q9H156 845 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 UNCXA6NJT0 531 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LRATO95237 230 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 VIPP01282 170 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HLA-DQA2P01906 255 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GAD2Q05329 585 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC20A2Q08357 652 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PTP4A2Q12974 167 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PPCDCQ96CD2 204 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MYOM1P52179 1685 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARVCFO00192 962 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ITPKAP23677 461 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SMIM11AP58511 58 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TAF13Q15543 124 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZBTB2Q8N680 514 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 COL6A2P12110 1019 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HMCESQ96FZ2 354 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ITCHQ96J02 903 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 EXO5Q9H790 373 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TSPAN19P0C672 248 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CDC42P60953 191 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CUZD1Q86UP6 607 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TBATAQ96M53 351 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OR52E6Q96RD3 313 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms