RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LRIG2O94898 1065 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A2P23975 617 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PARP15Q460N3 678 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SKA1Q96BD8 255 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC189A1A4V9 331 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC182A6NF36 153 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 URADA6NGE7 173 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN11O75508 207 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AP2A1O95782 977 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NR2F6P10588 404 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN9P43378 593 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OLR1P78380 273 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GPAT3Q53EU6 434 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SDCBP2Q9H190 292 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD11O43934 449 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SIN3BO75182 1162 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2ABP04908 130 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PKMP14618 531 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GK5Q6ZS86 529 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TIFAQ96CG3 184 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GPR20Q99678 358 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HAT1O14929 419 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TMCC2O75069 709 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX6P30041 224 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CD52P31358 61 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LIMK2P53671 638 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DLG2Q15700 870 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CACUL1Q86Y37 369 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HPS6Q86YV9 775 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DSELQ8IZU8 1212 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T3Q8NH03 318 aa21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP1P78357 1384 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CTPS1P17812 591 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MTX3Q5HYI7 312 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LPCAT4Q643R3 524 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RHBGQ9H310 441 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AP3D1O14617 1153 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GNPDA1P46926 289 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ABRQ12979 859 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 VSTM1Q6UX27 236 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAM220AQ7Z4H9 259 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RAB26Q9ULW5 256 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 QPRTQ15274 297 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CDH24Q86UP0 819 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS5Q969J3 196 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 S100A13Q99584 98 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SSR3Q9UNL2 185 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TIPRLO75663 272 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SLURP2P0DP57 97 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GBA3Q9H227 469 aa21.12■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GCATO75600 419 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAM155BO75949 473 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA5AQ13591 1074 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AP5B1Q2VPB7 878 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 IRGQQ8WZA9 623 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RPTORQ8N122 1335 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PGK1P00558 417 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ITGAXP20702 1163 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 EML3Q32P44 896 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PPCDCQ96CD2 204 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B11O75310 529 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms