RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 C5orf34Q96MH7 638 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OR52E6Q96RD3 313 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LGR4Q9BXB1 951 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MROH8Q9H579 483 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 U3KQV3 271 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM205CA6NFA0 338 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRIM64BA6NI03 449 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PDLIM1O00151 329 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CABYRO75952 493 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SASH3O75995 380 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 IGSF6O95976 241 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DNAJB2P25686 324 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 IGFALSP35858 605 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RPA4Q13156 261 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NAE1Q13564 534 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 INSCQ1MX18 579 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PARP6Q2NL67 630 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MTFR2Q6P444 385 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 USP30Q70CQ3 517 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ARCQ7LC44 396 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RIOX2Q8IUF8 465 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 WDR49Q8IV35 697 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GPR156Q8NFN8 814 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OR2T12Q8NG77 320 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DPF1Q92782 380 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 UFD1Q92890 307 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NODALQ96S42 347 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KXD1Q9BQD3 176 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RGCCQ9H4X1 137 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GNG13Q9P2W3 67 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AIPO00170 330 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CYB561D2O14569 222 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AURKAO14965 403 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RAMP2O60895 175 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC22A3O75751 556 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LINGO3P0C6S8 592 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LINC00032P0C843 101 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CHRNA5P30532 468 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NR2C2P49116 596 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC7A2P52569 658 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NAGLUP54802 743 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SIK1P57059 783 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PPP3CAQ08209 521 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SCGB2A2Q13296 93 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MAB21L1Q13394 359 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PON2Q15165 354 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALX1Q15699 326 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TKFCQ3LXA3 575 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KLHL26Q53HC5 615 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 XKR6Q5GH73 641 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ARSKQ6UWY0 536 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms