RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 TTC23Q5W5X9 447 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 METTL6Q8TCB7 284 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 C8orf48Q96LL4 319 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 EVPLLA8MZ36 301 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 SH3BP5O60239 455 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-201ENST00000264345 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 DGKAP23743 735 aa8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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HERC3-201ENST00000264345 HMX2A2RU54 273 aa8.84□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 H0Y626 953 aa8.84□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TULP3O75386 442 aa8.84□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.84□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 COL4A5P29400 1685 aa8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 OTCP00480 354 aa8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 UPP1Q16831 310 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 COQ5Q5HYK3 327 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.83□□□□□ -1
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HERC3-201ENST00000264345 GMIPQ9P107 970 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CLDN11O75508 207 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TIPRLO75663 272 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 AMHP03971 560 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LINC00032P0C843 101 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TACR2P21452 398 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CDH4P55283 916 aa8.83□□□□□ -1
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