RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc27a2O35488 620 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gstm1P10649 218 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RxrbP28704 520 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtel1Q0VGM9 1203 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem120bQ3TA38 339 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nudcd1Q6PIP5 582 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slco6c1Q8C0X7 706 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aipl1Q924K1 328 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Senp8Q9D2Z4 221 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Grm3Q9QYS2 879 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adamts20P59511 1906 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcm1Q9R0L6 2025 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klhl32A2AJX0 620 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcna10B2RQA1 511 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6309L7N481 315 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm3488M0QW81 238 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hnf1bP27889 558 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smad1P70340 465 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ctps1P70698 591 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppm1hQ3UYC0 513 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hsd3b5Q61694 373 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Htr1aQ64264 421 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SnphQ80U23 495 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfyve1Q810J8 777 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmc7Q8C428 726 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ApofQ91V80 315 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam173bQ9D1Z3 247 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GghQ9Z0L8 317 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm1141B9EJU1 475 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bmpr2O35607 1038 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CtsdP18242 410 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Msh2P43247 935 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmb4P99026 264 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam81aQ3UXZ6 364 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssx9Q6XAS3 170 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fastkd5Q7TMV3 762 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aph1bQ8C7N7 257 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 OlahQ8R197 265 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AadacQ99PG0 398 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Capns2Q9D7J7 247 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr63Q9EQQ3 425 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttll11A4Q9F4 727 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akap3O88987 864 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VdrP48281 422 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Polr3bP59470 1133 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SbplQ3TUY3 232 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trcg1Q58Y74 825 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glp2rQ5IXF8 512 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Casc4Q6P2L7 435 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prss50Q8BLH5 439 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Morc4Q8BMD7 928 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psma8Q9CWH6 250 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mzf1S4R1L6 814 aa28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf536Q8K083 1302 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm20828J3KMI7 228 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncam2O35136 837 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdlim1O70400 327 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Serpina3gQ5I2A0 440 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt73Q6NXH9 539 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp2c1Q80XR2 918 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm13199Q8C8E0 125 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1325Q8VF43 315 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TmlheQ91ZE0 421 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdzd3Q99MJ6 498 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nt5c3aQ9D020 331 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sertad3Q9ERC3 197 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4847G3X946 537 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pou2f3P31362 431 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ClgnP52194 611 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Epas1P97481 874 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trafd1Q3UDK1 580 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ephx3Q3V1F8 367 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adam2Q60718 735 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MelkQ61846 643 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GkQ64516 559 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnk12Q76M80 430 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pex5lQ8C437 567 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc26a5Q99NH7 744 aa28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.6 ms