RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 CCND2P30279 289 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HMGCLP35914 325 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MAN2A2P49641 1150 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 VEGFCP49767 419 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 P2RY4P51582 365 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RAB25P57735 213 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GCNT1Q02742 428 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CDH17Q12864 832 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BNIP3Q12983 259 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SGCGQ13326 291 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNC3Q14003 757 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF273Q14593 569 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 STAT4Q14765 748 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SMCO1Q147U7 214 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PDK2Q15119 407 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PON3Q15166 354 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DGUOKQ16854 277 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PGS1Q32NB8 556 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 INAVAQ3KP66 663 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRC66Q68CR7 880 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 WDR59Q6PJI9 974 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RFX8Q6ZV50 586 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 USP45Q70EL2 814 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DYMQ7RTS9 669 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TAC4Q86UU9 113 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FJX1Q86VR8 437 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC103Q8IW40 242 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RBFAQ8N0V3 343 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PDIK1LQ8N165 341 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KRT78Q8N1N4 520 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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SAMMSON-210ENST00000641260 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.21□□□□□ -1.42
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SAMMSON-210ENST00000641260 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RNF139Q8WU17 664 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TSPEARQ8WU66 669 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SNX19Q92543 992 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 IP6K1Q92551 441 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ELMO1Q92556 727 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 COPS5Q92905 334 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SNAPC3Q92966 411 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FBXW5Q969U6 566 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FBXL8Q96CD0 374 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 C9orf72Q96LT7 481 aa6.21□□□□□ -1.42
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SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF597Q96LX8 424 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 C10orf90Q96M02 699 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FOPNLQ96NB1 174 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PSMB7Q99436 277 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 APOL4Q9BPW4 351 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HINFPQ9BQA5 517 aa6.21□□□□□ -1.42
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SAMMSON-210ENST00000641260 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 COA4Q9NYJ1 87 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FETUBQ9UGM5 382 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 EBF1Q9UH73 591 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.21□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BTAF1O14981 1849 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC12A8A0AV02 714 aa6.2□□□□□ -1.42
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