RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM74	Q96NL1	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	OLFM1	Q99784	485 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TIMM22	Q9Y584	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	DCLK1	O15075	740 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	COL6A2	P12110	1019 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ELK4	P28324	431 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF6	P49848	677 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SGCD	Q92629	289 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf50	Q9BV19	199 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NME4	O00746	187 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SNAP29	O95721	258 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	FAS	P25445	335 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CLCN2	P51788	898 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	IL1RL1	Q01638	556 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	DPYS	Q14117	519 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RAB39A	Q14964	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	IMPG1	Q17R60	797 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MPP6	Q9NZW5	540 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	OR4Q2	P0C623	313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ALDH4A1	P30038	563 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ACADSB	P45954	432 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	FOXA1	P55317	472 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MERTK	Q12866	999 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	LRP8	Q14114	963 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NR1D2	Q14995	579 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MAPRE2	Q15555	327 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	HDAC10	Q969S8	669 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	KPNA6	O60684	536 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	B3GAT3	O94766	335 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	CYBA	P13498	195 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GFAP	P14136	432 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NPR3	P17342	541 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	HMOX2	P30519	316 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGEA12	P43365	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNC1	P48547	511 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	NPY2R	P49146	381 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GRB7	Q14451	532 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SQLE	Q14534	574 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	GPR180	Q86V85	440 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SPIN3-222	ENST00000639482	RANBP9	Q96S59	729 aa		10.05	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms