RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 CUZD1Q86UP6 607 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 RHEBL1Q8TAI7 183 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 TMEM169Q96HH4 297 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 ZNF558Q96NG5 402 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 CATSPER2Q96P56 530 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 DEFB118Q96PH6 123 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 MUC3BQ9H195 1237 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 ALG9Q9H6U8 611 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 MAFFQ9ULX9 164 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 SCN5AQ14524 2016 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 CBX4O00257 560 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 KLKB1P03952 638 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 CD1DP15813 335 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 MTTPP55157 894 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 CYTH1Q15438 398 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 20
CLN8-211ENST00000636934 MFN1Q8IWA4 741 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 TOX2Q96NM4 488 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 S100A14Q9HCY8 104 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.53■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.52■□□□□ 0.56
CLN8-211ENST00000636934 IRF1P10914 325 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 NUDT2P50583 147 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 INHBCP55103 352 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 NAA20P61599 178 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 GKN1Q9NS71 199 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HACD3Q9P035 362 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 VPS28Q9UK41 221 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.52■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PRRG1O14668 218 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 AIM2O14862 343 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 NDUFS3O75489 264 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PIRTP0C851 137 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 KCNA5P22460 613 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 EPHB3P54753 998 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 C1QTNF8P60827 252 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ATP6V0D1P61421 351 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HERVK_113P63132 956 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 RAB33AQ14088 237 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 NRG4Q8WWG1 115 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PHF21BQ96EK2 531 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 VCX3BQ9H321 246 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 POMPQ9Y244 141 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 CENPFP49454 3210 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 CCDC189A1A4V9 331 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TSPAN3O60637 253 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ZMPSTE24O75844 475 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 RHOBTB1O94844 696 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 URODP06132 367 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PYGLP06737 847 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 RFC2P35250 354 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 RGRP47804 291 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 APLP1P51693 650 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 ART3Q13508 389 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SQLEQ14534 574 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SEMA3AQ14563 771 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 CHSY3Q70JA7 882 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PIM3Q86V86 326 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 TMEM233B4DJY2 109 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 PDE5AO76074 875 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 SUPT7LO94864 414 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 BAG2O95816 211 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-211ENST00000636934 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms