RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NUS1Q96E22 293 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH19Q9H159 772 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC19Q9H756 370 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DONSONQ9NYP3 566 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBD1Q9UJT1 453 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-217ENST00000629983 COL12A1Q99715 3063 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD1O60671 282 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1DP48730 415 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ARSDP51689 593 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PTP4A2Q12974 167 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 AFMIDQ63HM1 303 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 HEATR4Q86WZ0 1026 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf20Q8ND61 904 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PATE1Q8WXA2 126 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPER2Q96P56 530 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SP110Q9HB58 689 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRC4Q9NPP4 1024 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TAB2Q9NYJ8 693 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAR1AP10644 381 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GP1BBP13224 206 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DESP17661 470 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GM2AP17900 193 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX5P35711 763 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR3P46089 330 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NDST2P52849 883 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXK1P85037 733 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1D2Q14995 579 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ECHDC3Q96DC8 303 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MCEEQ96PE7 176 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB18PQ96TA0 734 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DDA1Q9BW61 102 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A8Q9C0K1 460 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GANQ9H2C0 597 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALT6Q9UBX8 382 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC2Q9UJX6 822 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 UNGP13051 313 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CASRP41180 1078 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SCNN1BP51168 640 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 AIF1P55008 147 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GSCP56915 257 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SYCP1Q15431 976 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D9Q8NGE8 314 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK4Q9NYG8 393 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SUFUQ9UMX1 484 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRK1Q38SD2 2015 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD36A6QL64 1941 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC16A6NMB1 481 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB7A8K855 629 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM5P06731 702 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX6Q13608 980 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF12Q5T6F0 453 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS16Q9H269 839 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 OCIAD1Q9NX40 245 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DACH1Q9UI36 760 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DFFAO00273 331 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DAPK3O43293 454 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 THRAP10827 490 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CSF2RBP32927 897 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK7P49862 253 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CTBSQ01459 385 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPHQ15003 741 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DPCR1Q3MIW9 517 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DOK6Q6PKX4 331 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ10AQ96MF6 247 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM9Q9P0T7 183 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1DO15297 605 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX2-8O15522 239 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CR2P20023 1033 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR7P34969 479 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR1BP42025 376 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR1AP61163 376 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP11X2Q5H9J9 407 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKS6Q68DC2 871 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 RAET1GQ6H3X3 334 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DCUN1D2Q6PH85 259 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms