RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NNZ2 444 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH8O95206 1070 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CSF2P04141 144 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NME1P15531 152 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NR2C2P49116 596 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 EFHC2Q5JST6 749 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM131BQ86XD5 332 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX6Q8HWS3 928 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MPP6Q9NZW5 540 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 IL36AQ9UHA7 158 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QKU1 62 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINT1O43278 529 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPPL2P10696 532 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 UCNP55089 124 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.482e-14■■□□□ 13.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 PTK6Q13882 451 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LLGL1Q15334 1064 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CA9Q16790 459 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GUSBP11Q6P575 273 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC185Q8N715 623 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7D4Q8NG98 312 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNE4Q8WWG9 221 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CAVIN3Q969G5 261 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 WDCPQ9H6R7 721 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CD160O95971 181 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ADRB3P13945 408 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR7P34969 479 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL4AP40617 200 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ1P48048 391 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PQLC3Q8N755 202 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PLD5Q8N7P1 536 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC89Q8N998 374 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTL9Q8TC94 416 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK15Q8TD08 544 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC114Q96M63 670 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 HAPLN3Q96S86 360 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SATB2Q9UPW6 733 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NEMP2A6NFY4 417 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BRJ5 948 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NDC80O14777 642 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 APOL1O14791 398 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK10O43240 276 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK3P51956 506 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LY6DQ14210 128 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN3Q16667 212 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 BBOF1Q8ND07 529 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 P3H4Q92791 437 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DPH1Q9BZG8 443 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DYRK4Q9NR20 520 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH2P19823 946 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB7P26010 798 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PDX1P52945 283 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ARF5P84085 180 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MMRN1Q13201 1228 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 XRCC4Q13426 336 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NOMO1Q15155 1222 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 BROXQ5VW32 411 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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