RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ECEL1	O95672	775 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LIPC	P11150	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TCF4	P15884	667 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	KEL	P23276	732 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM23	P36406	574 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ETV3	P41162	512 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	KCNC4	Q03721	635 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	BIRC2	Q13490	618 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NCAPH	Q15003	741 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CNGA3	Q16281	694 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PIM3	Q86V86	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HSPH1	Q92598	858 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NUS1	Q96E22	293 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CEACAM5	P06731	702 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SKIL	P12757	684 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CCNB1	P14635	433 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF235	Q14590	738 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078		Q6ZVL8	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SEPT3	Q9UH03	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PPM1D	O15297	605 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LRCH4	O75427	683 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CP	P00450	1065 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PNLIP	P16233	465 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LHCGR	P22888	699 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	IL1R2	P27930	398 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	VIPR1	P32241	457 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HTR7	P34969	479 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CTBS	Q01459	385 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TRAF2	Q12933	501 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DPYS	Q14117	519 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ASIC2	Q16515	512 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	STX1A	Q16623	288 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TBR1	Q16650	682 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25

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