RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 STEAP3Q658P3 488 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HID1Q8IV36 788 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SFRP1Q8N474 314 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RDM1Q8NG50 284 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TRIB2Q92519 343 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC15Q96J42 360 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PEBP4Q96S96 227 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VPS28Q9UK41 221 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 A8MUA0 341 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CENPBD1B2RD01 187 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLC4A1P02730 911 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VTNP04004 478 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CBLP22681 906 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FASP25445 335 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AXLP30530 894 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VGLL4Q14135 290 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 Q5BKY6 102 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GLRX5Q86SX6 157 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FAM83AQ86UY5 434 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SPARTQ8N0X7 666 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RNF149Q8NC42 400 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP10Q96AY3 582 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ITCHQ96J02 903 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CDHR1Q96JP9 859 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP2Q99490 1192 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PORCNQ9H237 461 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF221Q9UK13 617 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 USP22Q9UPT9 525 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 A0A096LPK6 155 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TOMM70O94826 608 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TNNC2P02585 160 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 BMP2P12643 396 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ALOX12P18054 663 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRAP18433 802 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 HTR2BP41595 481 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 EPS8Q12929 822 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF460Q14592 562 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 STK11Q15831 433 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC38Q5VT99 294 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 UBA3Q8TBC4 463 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TASP1Q9H6P5 420 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PAK5Q9P286 719 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0X1KG70 313 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQ72 361 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FAM172BPA6NC97 362 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 M0QX08 132 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ACOX3O15254 700 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 STBD1O95210 358 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CPNE6O95741 557 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ALBP02768 609 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GSNP06396 782 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MAP2K4P45985 399 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TGFB2P61812 414 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TNFAIP2Q03169 654 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CAPSQ13938 189 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF6Q15052 776 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NOMO1Q15155 1222 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NPTX1Q15818 432 aa8.2□□□□□ -1.1
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