RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ETV5P41161 510 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00303Q3SY05 128 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 LZTR1Q8N653 840 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NUS1Q96E22 293 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SPTA1P02549 2419 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQ67 120 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AGRPO00253 132 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 B4GAT1O43505 415 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SOCS5O75159 536 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 LRCH4O75427 683 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CCNB1P14635 433 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CNGA3Q16281 694 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PHF19Q5T6S3 580 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 XKR5Q6UX68 686 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NRROSQ86YC3 692 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 USP7Q93009 1102 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TEX101Q9BY14 249 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PEX11BO96011 259 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 FUCA1P04066 466 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ITGB2P05107 769 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 FGF1P05230 155 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM5P06731 702 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CR2P20023 1033 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MAZP56270 477 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 HEATR4Q86WZ0 1026 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZFAND4Q86XD8 727 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZWILCHQ9H900 591 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 RDH14Q9HBH5 336 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf172C9J069 976 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SLC28A2O43868 658 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE6O95741 557 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 GZMAP12544 262 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 VIPR1P32241 457 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK10P53779 464 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 OR1D5P58170 312 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF235Q14590 738 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MAP9Q49MG5 647 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MANEAQ5SRI9 462 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PIM3Q86V86 326 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 DTX1Q86Y01 620 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 DTD2Q96FN9 168 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 GSDMCQ9BYG8 508 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQC6 194 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC53A6NM62 1247 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NR1D2Q14995 579 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 AMZ1Q400G9 498 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PGBD5Q8N414 524 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 EXTL1Q92935 676 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 NOD2Q9HC29 1040 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24.91■■□□□ 1.58
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PTPRF-216ENST00000617451 ALDH4A1P30038 563 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 PCK1P35558 622 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ETV3P41162 512 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CDK3Q00526 305 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ASIC2Q16515 512 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 DPYSL2Q16555 572 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 DENND2CQ68D51 928 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 VASH2Q86V25 355 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 MGME1Q9BQP7 344 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 CLMPQ9H6B4 373 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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