RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 AP3D1O14617 1153 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FSCN2O14926 492 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC34A1Q06495 639 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFA9Q16795 377 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ARCQ7LC44 396 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PLD4Q96BZ4 506 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 COPG2Q9UBF2 871 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PTPN9P43378 593 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PANX1Q96RD7 426 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CPQQ9Y646 472 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GVM2 712 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GPR25O00155 361 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PDE9AO76083 593 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C8AP07357 584 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ATP12AP54707 1039 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TRIQKQ629K1 86 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC185Q8N715 623 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SGK2Q9HBY8 427 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRB2O60241 1585 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CBX6O95503 412 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ABCG8Q9H221 673 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CAPN1P07384 714 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00032P0C843 101 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LINGO4Q6UY18 593 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PER2O15055 1255 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SCN2BO60939 215 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 STX11O75558 287 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB7O75635 380 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 H0YC42 278 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 PCED1BQ96HM7 432 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 C1orf50Q9BV19 199 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PTGES3LE9PB15 166 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LRATO95237 230 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RAB14P61106 215 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CACNG1Q06432 222 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NOMO1Q15155 1222 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NEK5Q6P3R8 708 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB2Q8N680 514 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDP1-208ENST00000613122 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DGKGP49619 791 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 COL20A1Q9P218 1284 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ACLYP53396 1101 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GNA12Q03113 381 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PHC3Q8NDX5 983 aa20.18■□□□□ 0.82
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