RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	DAPK3	O43293	454 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	CPNE6	O95741	557 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	FGF1	P05230	155 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	CEACAM5	P06731	702 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	GNPDA1	P46926	289 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	AP1S1	P61966	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	UBXN1	Q04323	297 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	IL10RB	Q08334	325 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	NR1D2	Q14995	579 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	PTPRR	Q15256	657 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	PIM3	Q86V86	326 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS5-208	ENST00000599909	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SUV39H1	O43463	412 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ECEL1	O95672	775 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DES	P17661	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	LHCGR	P22888	699 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CD82	P27701	267 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CD1C	P29017	333 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MIP	P30301	263 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	VIPR1	P32241	457 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ETV3	P41162	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	POLD2	P49005	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CDK3	Q00526	305 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DPYS	Q14117	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	NAGS	Q8N159	534 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PGBD5	Q8N414	524 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	BSN	Q9UPA5	3926 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909		A0A0U1RQS6	177 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PPM1D	O15297	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PEX11B	O96011	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CP	P00450	1065 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	FER	P16591	822 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CR2	P20023	1033 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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