RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 GANCQ8TET4 914 aa11.68□□□□□ -0.54
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CAPNS1-209ENST00000590049 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.68□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF157Q96PX1 679 aa11.68□□□□□ -0.54
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM72BQ86X60 149 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.65□□□□□ -0.54
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