RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PRPSAP2	O60256	369 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RNF8	O76064	485 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PCCB	P05166	539 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CTSE	P14091	401 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	HTR1B	P28222	390 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SERPINA4	P29622	427 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	MIP	P30301	263 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	MMP12	P39900	470 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CSNK1D	P48730	415 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ELOC	Q15369	112 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ALG11	Q2TAA5	492 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	AFMID	Q63HM1	303 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	DAAM2	Q86T65	1068 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CREG2	Q8IUH2	290 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NPW	Q8N729	165 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ANKRD7	Q92527	254 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NAT6	Q93015	286 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	HES6	Q96HZ4	224 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SP110	Q9HB58	689 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.63	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	TCEA3	O75764	348 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RASGRP1	O95267	797 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PRB1	P04280	392 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	MCM3	P25205	808 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC1A1	P43005	524 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CXADR	P78310	365 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	BCL2L1	Q07817	233 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NFATC4	Q14934	902 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	AGER	Q15109	404 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC181	Q5TID7	509 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PAF1	Q8N7H5	531 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF653	Q96CK0	615 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	THSD1	Q9NS62	852 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	KL	Q9UEF7	1012 aa		15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	LRCH4	O75427	683 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ALPI	P09923	528 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SCNN1B	P51168	640 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	IL10RB	Q08334	325 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	KCTD16	Q68DU8	428 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ARL10	Q8N8L6	244 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	KY	Q8NBH2	561 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC39A7	Q92504	469 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	GPR34	Q9UPC5	381 aa		15.61	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ATM	Q13315	3056 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514		A8MX80	341 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ELFN1	P0C7U0	828 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	HCAR3	P49019	387 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RALGDS	Q12967	914 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	MTM1	Q13496	603 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	DPYS	Q14117	519 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	SPIDR	Q14159	915 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP2R5E	Q16537	467 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	GKN2	Q86XP6	184 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		15.6	■□□□□ 0.09
LLGL2-221	ENST00000583514	ATL2	Q8NHH9	583 aa		15.6	■□□□□ 0.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms