RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579466.1

MSI2-208, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 186 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-208	ENST00000579466	PRKAR1A	P10644	381 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CCNB1	P14635	433 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PNLIP	P16233	465 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CSF2RB	P32927	897 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	UGT1A3	P35503	534 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	STAT1	P42224	750 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	POLD2	P49005	469 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	JAM2	P57087	298 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	UBE2H	P62256	183 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	OGDH	Q02218	1023 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	AGER	Q15109	404 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	IGFBP7	Q16270	282 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CNGA3	Q16281	694 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CA9	Q16790	459 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PNCK	Q6P2M8	343 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	XKR5	Q6UX68	686 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	DPPA4	Q7L190	304 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	NRROS	Q86YC3	692 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TAAR9	Q96RI9	348 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	LRRC19	Q9H756	370 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	DACH1	Q9UI36	760 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SUFU	Q9UMX1	484 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466		A0A0U1RQS6	177 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	EFCAB7	A8K855	629 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466		A8MU76	341 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	WASH4P	A8MWX3	477 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TNFRSF10C	O14798	259 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	RAD1	O60671	282 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	FUCA1	P04066	466 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	FGF1	P05230	155 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CD1C	P29017	333 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ETV3	P41162	512 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ACTR1B	P42025	376 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ACTR1A	P61163	376 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CTBS	Q01459	385 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	KCNAB2	Q13303	367 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PTPRR	Q15256	657 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	KRT31	Q15323	416 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ANKS6	Q68DC2	871 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	MON1B	Q7L1V2	547 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TRIM74	Q86UV6	250 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	NPW	Q8N729	165 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CTRC	Q99895	268 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SEMA3C	Q99985	751 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CNPY3	Q9BT09	278 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	SEPT3	Q9UH03	358 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CD84	Q9UIB8	345 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	PPM1D	O15297	605 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	NKX2-8	O15522	239 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	DUX1	O43812	170 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CP	P00450	1065 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	CEACAM5	P06731	702 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	TPM2	P07951	284 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	THRA	P10827	490 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MSI2-208	ENST00000579466	DES	P17661	470 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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