RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559891.1

TM2D3-208, Transcript of TM2 domain containing 3, human

TSL 1 (best)

Gene TM2D3, Length 2,133 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TM2D3-208	ENST00000559891	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	EDA	Q92838	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	EID2B	Q96D98	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RMDN1	Q96DB5	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CASS4	Q9NQ75	786 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	DMD	P11532	3685 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CCL22	O00626	93 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PIAS1	O75925	651 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ANP32D	O95626	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SLC4A1	P02730	911 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	DRD3	P35462	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ABL2	P42684	1182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MAGEA3	P43357	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MTAP	Q13126	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SHD	Q96IW2	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SPINT1	O43278	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	KRT16	P08779	473 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	TIMP2	P16035	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	NDUFV2	P19404	249 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	TAC1	P20366	129 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SERPINA4	P29622	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MGAT5	Q09328	741 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891		A0A1W2PP55	124 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	DCX	O43602	365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	NDST3	O95803	873 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	GABRG2	P18507	467 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	HNF1B	P35680	557 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	MSH2	P43246	934 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	IL9R	Q01113	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	CST6	Q15828	149 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	HIF1A	Q16665	826 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TM2D3-208	ENST00000559891	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms