RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DES	P17661	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CASP14	P31944	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKE	P52429	567 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FMO1	Q01740	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SATB1	Q01826	763 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCD1	Q15116	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LPAL2	Q16609	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZS52	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EMC1	Q8N766	993 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBCB	Q99426	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		R4GN57	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		F5H5T6	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		K7EQS6	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	AKR1B10	O60218	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RTN2	O75298	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MOCS3	O95396	460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	F9	P00740	461 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CALB1	P05937	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FYN	P06241	537 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SP9	P0CG40	484 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC2A3	P11169	496 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TACR2	P21452	398 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GPD1	P21695	349 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXC13	P31276	330 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SDC4	P31431	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC6A4	P31645	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCR1	P32246	355 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OPRD1	P41143	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MATK	P42679	507 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCR3	P51677	355 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SCAND1	P57086	179 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RAC3	P60763	192 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NOMO3	P69849	1222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBED6	P86452	979 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAP	Q12884	760 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBR1	Q16650	682 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CT83	Q5H943	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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