RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 CUL2Q13617 745 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 STARD3Q14849 445 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC157Q569K6 752 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RAB41Q5JT25 222 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ATL3Q6DD88 541 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CHST9Q7L1S5 443 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 NAXDQ8IW45 347 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.13□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A087X1B8 175 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 UBE2QL1A1L167 161 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM149AA5PLN7 773 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 O00370 1275 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CETN3O15182 167 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MYL1P05976 194 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 COG7P83436 770 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 NFIL3Q16649 462 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 HLA-BQ31612 363 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PMF1Q6P1K2 205 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM270Q6UE05 265 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RRAGAQ7L523 313 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 UBR7Q8N806 425 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CEP76Q8TAP6 659 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MDM1Q8TC05 714 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ARL8AQ96BM9 186 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MIS12Q9H081 205 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GAREM1Q9H706 876 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 USP25Q9UHP3 1055 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MYH10P35580 1976 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CACNA1EQ15878 2313 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A1B0GTW7 788 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 M0QYV0 167 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 TBL1XO60907 577 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MFAP3LO75121 409 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 FSBPO95073 299 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ACADMP11310 421 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GNSP15586 552 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 GTF2H1P32780 548 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 HOXD12P35452 270 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 CHKAP35790 457 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BCAT1P54687 386 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 DAOAP59103 153 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 APBA1Q02410 837 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 SCAPQ12770 1279 aa7.11□□□□□ -1.27
GNPTAB-209ENST00000552009 ENPP2Q13822 863 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms