RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 MLKLQ8NB16 471 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CTRCQ99895 268 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ZMYND15Q9H091 742 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 VPS16Q9H269 839 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 LRRC19Q9H756 370 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 A0A0U1RQS6 177 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 A8MU76 341 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 WASH4PA8MWX3 477 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TNFRSF10CO14798 259 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 PPM1DO15297 605 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 RAD1O60671 282 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CSF2RBP32927 897 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TRIM23P36406 574 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SCNN1BP51168 640 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TPI1P60174 286 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 BCL2L1Q07817 233 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 GRM3Q14832 879 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CA9Q16790 459 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DOK6Q6PKX4 331 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DPPA4Q7L190 304 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ZNF677Q86XU0 584 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 MCEEQ96PE7 176 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SUFUQ9UMX1 484 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 EFCAB7A8K855 629 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DFFAO00273 331 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CEACAM5P06731 702 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SOX5P35711 763 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CCR10P46092 362 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 LIMK2P53671 638 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CTBSQ01459 385 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 AFMIDQ63HM1 303 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ANKS6Q68DC2 871 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 NAGSQ8N159 534 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 NUS1Q96E22 293 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 NBASA2RRP1 2371 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ETV3P41162 512 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 STAT1P42224 750 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 FOXK1P85037 733 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 OGDHQ02218 1023 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CNGA3Q16281 694 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 C3orf20Q8ND61 904 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 COQ10AQ96MF6 247 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 SP110Q9HB58 689 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 PLAAQ9Y263 795 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 CFAP69A5D8W1 941 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 JAM2P57087 298 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 BECN1Q14457 450 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-227ENST00000551441 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms