RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1B0GVM2	712 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SMIM24	O75264	130 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ABLIM3	O94929	683 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PSMG1	O95456	288 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	C1R	P00736	705 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PYGL	P06737	847 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	IMPDH1	P20839	514 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ARNT	P27540	789 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CD86	P42081	329 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC1A2	P43004	574 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	NRIP1	P48552	1158 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC11A1	P49279	550 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP4B	P51164	291 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	GNA12	Q03113	381 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	STX5	Q13190	355 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CRY1	Q16526	586 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	STK40	Q8N2I9	435 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR78	Q96P69	363 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TTC1	Q99614	292 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	MIPEP	Q99797	713 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	OMD	Q99983	421 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	NACA2	Q9H009	215 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ITM2A	O43736	263 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP2	P08253	660 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	FGF4	P08620	206 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	KIT	P10721	976 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	GABRB3	P28472	473 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	CPOX	P36551	454 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	CLCN4	P51793	760 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP8	P85298	464 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PFKP	Q01813	784 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	GRIK2	Q13002	908 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	DUSP4	Q13115	394 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	TAF12	Q16514	161 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTA3	Q16772	222 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	KY	Q8NBH2	561 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.83	□□□□□ -0.52	3e-9	■■□□□ 11.5
LETMD1-223	ENST00000550442	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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