RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD11Q96NU1 681 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TLR10Q9BXR5 811 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf18Q9UK00 162 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087WXM4 84 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 A8MX80 341 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CCL16O15467 120 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TMCC2O75069 709 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PIGNO95427 931 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ADRB2P07550 413 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SNHG28P0DPA3 235 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PTSQ03393 145 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SLC34A1Q06495 639 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PTPRNQ16849 979 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RFX4Q33E94 735 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CAPNS2Q96L46 248 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087X0B3 334 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 E9PAM4 449 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 DCXO43602 365 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 VIPP01282 170 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FAM163BP0C2L3 166 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ERCC2P18074 760 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CCNCP24863 283 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CASP5P51878 434 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FMO1Q01740 532 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CDK18Q07002 472 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RPTNQ6XPR3 784 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 OAFQ86UD1 273 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 RHOJQ9H4E5 214 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PADI3Q9ULW8 664 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ARL5CA6NH57 179 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB3O15480 346 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NDST3O95803 873 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C8GP07360 202 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA6P08185 405 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TFEBP19484 476 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ARL2P36404 184 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CCNFP41002 786 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF844Q08AG5 666 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 BMPR2Q13873 1038 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CREG2Q8IUH2 290 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TTLQ8NG68 377 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MDM4O15151 490 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 UBOX5O94941 541 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PLK1P53350 603 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 GAD2Q05329 585 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF3Q13114 568 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PRKG2Q13237 762 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TEX44Q53QW1 395 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CES3Q6UWW8 571 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 STK32CQ86UX6 486 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 CERS5Q8N5B7 392 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C12orf29Q8N999 325 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 HDAC10Q969S8 669 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NID2Q14112 1375 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 C4BP0C0L5 1744 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-226ENST00000546160 NUP205Q92621 2012 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MCIDASD6RGH6 385 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FCHO1O14526 889 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RFXANKO14593 260 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GABRB2P47870 512 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AP1S1P61966 158 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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