RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SLC26A2	P50443	739 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	UGT2B15	P54855	530 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CDH13	P55290	713 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RAB10	P61026	200 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ITPK1	Q13572	414 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	STARD3	Q14849	445 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CRY2	Q49AN0	593 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RNF148	Q8N7C7	305 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	VPS39	Q96JC1	886 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.19	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ARPC2	O15144	300 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	OGT	O15294	1046 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZW10	O43264	779 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ITGAM	P11215	1152 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	UBL4A	P11441	157 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	BMP4	P12644	408 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PRKCA	P17252	672 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ITGA2	P17301	1181 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PAM	P19021	973 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MGAT1	P26572	445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ADORA2A	P29274	412 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TIE1	P35590	1138 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GNPDA1	P46926	289 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	RAB25	P57735	213 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	GJA9	P57773	515 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	OLR1	P78380	273 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NFKB2	Q00653	900 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TRAF3	Q13114	568 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	IKZF1	Q13422	519 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PGS1	Q32NB8	556 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	PPM1J	Q5JR12	505 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ZNF280D	Q6N043	979 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78	5e-9	■□□□□ 8.9
UBC-213	ENST00000546120	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ESX1	Q8N693	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CCDC185	Q8N715	623 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	POC5	Q8NA72	575 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	LRRC58	Q96CX6	371 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
UBC-213	ENST00000546120	MARK4	Q96L34	752 aa		10.18	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms