RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 CEACAM5P06731 702 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 TPM2P07951 284 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 DESP17661 470 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 CD1CP29017 333 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 GPR3P46089 330 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 ATP1A2P50993 1020 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PQ67 120 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-210ENST00000527027 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-210ENST00000527027 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 LIFP15018 202 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 PSMA2P25787 234 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 VIPR1P32241 457 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 CDK3Q00526 305 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 CTBSQ01459 385 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRU-210ENST00000527027 KCNAB2Q13303 367 aa16.08■□□□□ 0.16
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